第一部剧情：

一名年轻的网络黑客尼奥发现看似正常的现实世界实际上是由一个名为“矩阵”的计算机人工智能系统控制的，人们就象他放牧的动物一样。尼奥在网络上查找关于“矩阵”的一切。在一名神秘女郎崔妮提的引导下，尼奥见到了黑客组织的首领墨菲斯，三人一起走上了抗争“矩阵”的征途，然而问题并不是那么简单……

票房收入：

【制作成本】95000000 美元

【首映票房】27,788,331.00 美元

【全美票房】171,479,930.00 美元

【海外票房】288,900,000.00 美元

第二部剧情：

上回说到NEO终于意识到自己的能力和使命。NEO中弹复活后变成了无所不能的“救世主”，他将带领锡安基地的人民，打响对机器世界的反击战。与此同时，矩阵系统决定先下手为强，派遣了为数25万的电子乌贼大军，开始进攻锡安基地。尼奥他们决定再次潜入矩阵，从内部破坏它。在寻找矩阵系统内唯一知道系统弱点的“制钥者”的过程中，尼奥、墨菲斯和翠尼蒂遇到了前所未有的困难：敌人的能力已升级，数量更是大大增加。NEO将带领锡安基地的人民，打响对机器世界的反击战，并将以胜利者的姿态结束这场战斗，还人类以自由之身。他的使命会实现吗？矩阵会那么甘心被摧毁吗？在这集中，尼奥探寻自己使命背后真相，为自己的行动寻找一个可以接受的理由

第三部剧情：

尼奥被困在一个“中空”地带：那里既不是母体，也不是机器占领的真实世界，而是一个地铁站。他醒来时遇到了一个印度小女孩和她的父母。“火车人”控制着该车站跟母体与机器世界之间的交通。墨菲斯、翠妮蒂与Logos号飞船的奈奥比会合。他们从“先知”那里知道尼奥的现状，去找梅罗纹奇要人，将尼奥带回现实。在跟“先知”交谈之后，尼奥明白了自己的使命。墨菲斯和奈奥比杀回锡安，和基地的人们共同对抗机器大军的进攻。翠妮蒂不愿意和尼奥分开，决心放弃一切和尼奥共同前往机器世界的圣地。奈奥比虽然不相信先知的话，但她开始相信尼奥，把自己那艘最快的飞船借给尼奥。锡安城的人类已决定展开最后的自救行动，他们组织起了所有的APU，和25万电子章鱼以及大型钻探机器展开了决斗。最终尼奥完成了自己的生存的意义……